Свечи с встроенным резистором, только вот которые это свечи из двух комплектов? Была мысль сравнить старые и новые.
К свечам с встроенным резистором резисторы в наконечниках не нужны, можно их заменить вставкой провода.
Была еще разница по сопротивлениям комплекта провод-наконечник.
Визуально наконечники на пробой проверены? Именно осмотром на прожег пластика.
Может и ЭБУ, но не хотелось бы в это верить и сначала лучше исключить простые вещи. Основная причина указанных ошибок, это питание, но вроде как исключили это предположение. Дальше идем провода, свечи.