Ключевое слово "периодически". Значит дело не деталях ЦПГ, коленвала, маховика и их балансировке.
Я бы в первую очередь посмотрел электрику (свечи, провода, катушки), затем подсос воздуха ну и топливную систему. Ну и за оборотами бы последить надо как ведут при дерганье, по компу конечно, а не...