ВикМан,
вылетает скорость, значит снимать КП, можно будет покрутить выжимной в руках. Если делать передачу, то вскрывать КП, а уж если вскрыл, то можно и откапиталить. Как соберешь все назад, шум исчезнет.
Скорее всего подшипники. А с прогревом двигателя, разогревается и КП и шум скорее всего...