Ну ,вобщем, ни чего нового не скажу,
волк67 уже всё рассказал....мне ребята кинули ссылку,чтоб время на объяснения не тратить:
Документы, необходимые для проезда граждан России в Калининградскую область транзитом через территорию Литвы
1. Проездной документ (билет). 
2. Документ, удостоверяющий личность пассажира, реквизиты которого указаны в проездном документе (билете). К ним относятся: 
- дипломатический паспорт; 
- служебный паспорт; 
- заграничный паспорт Российской Федерации; 
- паспорт моряка (при наличии записи в судовой роли либо надлежащим образом заверенной выписки из нее); 
- свидетельство на возвращение (для однократного возвращения в Российскую Федерацию). 
3. Документ, дающий право на транзитный проезд через территорию Литвы. К ним относятся: 
- виза Литовской Республики; 
- вид на жительство Литовской Республики; 
- карточка аккредитации категории "А" либо "В" Литовской Республики; 
- упрощенный транзитный документ (УТД); 
- упрощенный проездной документ на железной дороге (УПД-ЖД*). 
Срок действия документа, удостоверяющего личность гражданина Российской Федерации, должен превышать срок действия документа, действительного для транзитного проезда через территорию Литовской Республики. 
УПД-ЖД (упрощённый проездной документ по железной дороге) является специальным документом для однократного транзитного проезда через территорию Литовской Республики в Калининградскую область и обратно. Он действителен не более трех месяцев и выдается бесплатно компетентными литовскими представителями в транзитных поездах до пересечения государственной границы Литовской Республики. Решение об оформлении УПД-ЖД принимается дипломатическим и консульскими учреждениями Литовской Республики в Российской Федерации по информации, передаваемой через железнодорожные кассы на территории Российской Федерации. 
УПД-ЖД может быть использован только при следовании в транзитных поездах регулярного сообщения на следующих маршрутах: 
- Москва - Калининград (поезд № 29); 
- Москва - Калининград (поезд №147); 
- Санкт-Петербург - Калининград (поезд №79); 
- Челябинск - Калининград (поезд №425); 
- Адлер - Калининград (поезд №360С); 
- Мурманск - Калининград (беспересадочный вагон); 
- Калининград - Москва (поезда № 30); 
- Калининград - Москва (поезд №148); 
- Калининград - Санкт-Петербург (поезд №80); 
- Калининград - Челябинск (поезд №426); 
- Калининград - Адлер (поезд №360Ч); 
- Калининград - Мурманск (беспересадочный вагон). 
ну и далее по тексту:
http://traintickets.ru/info/poryadok_proezda_v_kaliningrad