Вы проверяли сам ЭБУ? Может контакты окислились, отвалились, коротит? Может влага в нем?.
У меня обычно выдает ошибки неисправности памяти ЭБУ (62,63,64) после того, когда я снимаю клеммы аккумулятора более чем на минуту. Т.е. какие-то настройки стираются. После такого рекомендуется на ХХ дать...